在毁灭之谷的小智一行人，被卖土特产的重盛老人拦下，买了特产毁灭之谷仙贝，重盛老人热情的为众人讲解起了毁灭之谷的超源。
原来这里有股强大邪恶力量——巨大念力土偶，四处破坏周围，后来一位白色的贤者出现召唤出一个巨大的岩石精灵球将其封印在了山顶的湖泊中。
随后，老人便带着小智等人参观了湖泊上的巨大岩石精灵球，由于最近火箭队好像被天王皮卡丘的实力吓到了，也就没有出现捣破坏，小智等人参观完后便顺利的离开了。
小智等人又认识到了莎由莉与她的搭档大嘴娃，而大嘴娃喜欢上了小刚那呆呆的莲帽小童，但莲帽小童不小心使用了莎由莉的水之石进化成了乐天派的乐天河童，大嘴娃瞬间把它甩了，喜欢上了呆呆的可达鸭。
失恋的乐天河童与小刚一起跳起了舞。
而小智则在城镇上，将蜥蜴王与比雕传送回去，将顿甲与雷电兽传送回来，并给它们服下神奇糖果达到了道馆初期。
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见证到了移情别恋的大嘴娃后，小智等人又又又一次迷路了，来到了一处充满大坑的荒地。
“这里到底是什么地方啊？仅仅只是一座岛屿我们不会又迷路了吧！”小智无语道。
“皮卡～”“布伊～”皮卡丘与伊布也无奈的摇了摇头。
小胜操作着领航员，叹气道：“根本找到这里的位置耶。”
“这里在伊札贝的细部地图上也完全没有记载。”小刚也拿着旅游书不断翻找无奈道，“如果不从这里穿过我们只能原路返回，再重新绕路出发了！”
“什么？！原路返回，绕路出发！”小遥当即不干了，好不容易才走到这又要返回又要绕路的怎么可能！
“要不，我们找找附近有没有人，打听一下路。”小智提议道。
随后，提议得到了众人的认可，毕竟谁也不想原路返回，众人接着又打量起了地上的深坑。
“这是什么洞啊？”小胜疑惑的问道。
小刚摇了摇头表示不晓得。
小智则感受到了下方的神奇宝贝波导，于是将一块神奇宝贝食物扔下，在深坑中，突然从地下钻出一个大脑袋猛然张开嘴巴将神奇宝贝食物吃下。
小刚三人顿时大吃一惊，小遥更是拿出图鉴一扫：
大颚蚁。。。。。。
而小智的眼神已经变亮了，大颚蚁正是沙漠蜻蜓的最初形态，这可是纯正的龙系神奇宝贝啊！
大颚蚁吃完神奇宝贝食物后，立马遁入地底，只是小智看上它怎么可能让跑了！
“皮卡丘，伊布，走！让我们去收服它！”说完小智便带着伊布与皮卡丘跳进了深坑，顿时将他们淹没！
“小智！”众人惊呼一声，刚想跳下去，去追小智，却一声不速之音打断！
嘀呦～嘀呦～一个车顶有着警灯的越野车来到了众人这边，下来了一位身穿越野服显得十分干净利落的小姐姐从车上下来。
“你们几个，快点离开那个深坑，那里可是很危险的！而且这里是禁止进入的危险区域！”小姐姐呵斥道。
听到这里是危险区域，小刚三人当场急坏了，要知道小智可是跳下去了！小刚都没心情去搭讪小姐姐足以看出他心中的着急，小遥更是想跳下去找小智，还好被小刚眼疾手快的抓住小遥。
小胜连忙将他们同伴跳下去的事情告诉了小姐姐，小姐姐震惊不已，连忙带着小刚三人找自己的青梅竹马寻求帮助！
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另一边小智跳下深坑，来到了一个巨大通道，在小智的波导感受下，发现这里无数通道相连可以说是一个地下迷宫！
随后，小智的波导之力发现了那只大颚蚁的位置，“在这边！”小智招呼皮卡丘与伊布来到他的肩上，向其中一个通道追去。
就这样小智一路追着大颚蚁来到了，一处湖泊前，而眼前的美景着实震惊到了小智，“好美啊！”小智词汇中跟本找不到可以形容这里美景的词语。
“皮卡～”“布伊～”皮卡丘与伊布也震惊的点了点头。
只见那清澈如镜面般的湖泊在阳光的照射之下闪烁着亮晶晶的光芒！
在头顶上还有一个巨大的天然裂口，无数的阳光从裂口中散落在湖泊之上，两者相互依衬，可以说在整个神奇宝贝世界上这样的美景屈指可数啊！
“皮卡皮～”皮卡丘指着一个方向发声道。
小智顺着方向看去，一只大颚蚁正向一湖泊另一侧走去。
“站住！大颚蚁！”小智上前拦住了大颚蚁，拿出一枚精灵球，“我要收服你！”
大颚蚁竟然真的停下，充满战意的看着小智。